********************************************************************************
XSTREME - Motif Discovery and Enrichment Analysis
********************************************************************************
MEME version 5.5.1 (Sun Jan 29 10:33:12 2023 -0800)

For further information on how to interpret these results please access https://meme-suite.org/meme.
To get a copy of the MEME Suite software please access https://meme-suite.org.

********************************************************************************


********************************************************************************
REFERENCE
********************************************************************************
If you use this program in your research, please cite:

Charles E. Grant and Timothy L. Bailey, "XSTREME: comprehensive motif analysis of biological sequence datasets",
BioRxiv, September 3, 2021.
********************************************************************************


ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies (from file `xstreme_example_output_files/background'):
A 0.22190 C 0.27810 G 0.27810 T 0.22190 

MOTIF 2-GCTGAGTCATN STREME-2

letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 181 E= 8.5e-004
  0.016567	  0.020591	  0.928765	  0.034078	
  0.157305	  0.767699	  0.047690	  0.027306	
  0.013760	  0.000272	  0.000272	  0.985697	
  0.000217	  0.007042	  0.978984	  0.013758	
  0.972151	  0.000272	  0.007042	  0.020536	
  0.027301	  0.217058	  0.755425	  0.000217	
  0.000217	  0.000272	  0.000272	  0.999240	
  0.003026	  0.996486	  0.000272	  0.000217	
  0.999240	  0.000272	  0.000272	  0.000217	
  0.020530	  0.185988	  0.103186	  0.690296	
  0.218358	  0.290512	  0.318782	  0.172349	

MOTIF CCASYAGRKGGCRSY MEME-4

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 214 E= 4.6e-056
  0.060748	  0.887850	  0.000000	  0.051402	
  0.000000	  0.995327	  0.000000	  0.004673	
  0.668224	  0.009346	  0.168224	  0.154206	
  0.000000	  0.607477	  0.392523	  0.000000	
  0.140187	  0.383178	  0.116822	  0.359813	
  0.813084	  0.000000	  0.079439	  0.107477	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.350467	  0.000000	  0.640187	  0.009346	
  0.046729	  0.000000	  0.630841	  0.322430	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.032710	  0.000000	  0.925234	  0.042056	
  0.186916	  0.719626	  0.000000	  0.093458	
  0.336449	  0.051402	  0.565421	  0.046729	
  0.098131	  0.528037	  0.303738	  0.070093	
  0.144860	  0.364486	  0.116822	  0.373832	

MOTIF 4-AGATAAGG STREME-4

letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 288 E= 4.1e-002
  0.938337	  0.022526	  0.009024	  0.030113	
  0.097030	  0.021313	  0.846658	  0.034999	
  0.995108	  0.001520	  0.001795	  0.001576	
  0.000278	  0.005741	  0.038524	  0.955457	
  0.949772	  0.001293	  0.028184	  0.020752	
  0.949294	  0.017704	  0.031024	  0.001978	
  0.137158	  0.028070	  0.828203	  0.006570	
  0.113510	  0.177531	  0.673227	  0.035732	

MOTIF SCCCCGCCCCC MEME-3

letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 324 E= 1.3e-045
  0.064815	  0.283951	  0.506173	  0.145062	
  0.052469	  0.734568	  0.000000	  0.212963	
  0.000000	  0.799383	  0.061728	  0.138889	
  0.058642	  0.938272	  0.000000	  0.003086	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.175926	  0.000000	  0.641975	  0.182099	
  0.000000	  0.962963	  0.037037	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.753086	  0.000000	  0.246914	
  0.033951	  0.898148	  0.000000	  0.067901	
  0.000000	  0.765432	  0.095679	  0.138889	

MOTIF 3-GCGCATGCGCAC STREME-3

letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 82 E= 1.4e-002
  0.094025	  0.000625	  0.889266	  0.016084	
  0.062843	  0.889272	  0.047387	  0.000499	
  0.016084	  0.000625	  0.982792	  0.000499	
  0.000499	  0.967206	  0.016210	  0.016084	
  0.795572	  0.109769	  0.094160	  0.000499	
  0.031669	  0.203319	  0.047387	  0.717625	
  0.000499	  0.016210	  0.982792	  0.000499	
  0.000499	  0.936030	  0.000625	  0.062846	
  0.016084	  0.016213	  0.951618	  0.016084	
  0.000499	  0.951615	  0.000625	  0.047260	
  0.764393	  0.047396	  0.187713	  0.000499	
  0.140783	  0.608640	  0.203322	  0.047254	

MOTIF 5-CACTTCCTGKT STREME-5

letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 87 E= 4.3e-002
  0.155575	  0.579884	  0.145498	  0.119043	
  0.998521	  0.000529	  0.000529	  0.000422	
  0.000422	  0.998627	  0.000529	  0.000422	
  0.026785	  0.000529	  0.000529	  0.972157	
  0.000422	  0.000529	  0.000529	  0.998521	
  0.026780	  0.972269	  0.000529	  0.000422	
  0.000422	  0.998627	  0.000529	  0.000422	
  0.000422	  0.013708	  0.211416	  0.774454	
  0.119033	  0.099502	  0.781042	  0.000422	
  0.167523	  0.054813	  0.295981	  0.481683	
  0.184946	  0.199818	  0.182858	  0.432378	

MOTIF MA0102.3 CEBPA

letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 117 E= 1.87e-007
  0.675741	  0.086957	  0.237303	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  0.999999	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  0.999999	
  0.046024	  0.000000	  0.737955	  0.216020	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.780520	  0.083170	  0.069591	  0.066719	
  0.173652	  0.499674	  0.000000	  0.326675	
  0.798146	  0.201854	  0.000000	  0.000000	
  0.999999	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.371328	  0.117770	  0.510902	
  0.378901	  0.323998	  0.058102	  0.239000	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0102.3

MOTIF MA0488.1 JUN

letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 90 E= 3.76e-006
  0.388258	  0.133155	  0.233403	  0.245183	
  0.339374	  0.140118	  0.237743	  0.282764	
  0.309805	  0.090757	  0.461751	  0.137686	
  0.788153	  0.034767	  0.177079	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.994325	  0.005675	
  0.999952	  0.000000	  0.000000	  0.000048	
  0.000000	  0.163964	  0.215185	  0.620851	
  0.000000	  0.028997	  0.971003	  0.000000	
  0.044735	  0.168399	  0.000000	  0.786866	
  0.329264	  0.670736	  0.000000	  0.000000	
  1.000000	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.009681	  0.176650	  0.048455	  0.765214	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0488.1

MOTIF GACTACAWYTCCCAG MEME-6

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 23 E= 8.9e-014
  0.217391	  0.043478	  0.739130	  0.000000	
  0.913043	  0.086957	  0.000000	  0.000000	
  0.043478	  0.956522	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.173913	  0.000000	  0.826087	
  1.000000	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.826087	  0.000000	  0.173913	  0.000000	
  0.434783	  0.043478	  0.000000	  0.521739	
  0.000000	  0.478261	  0.086957	  0.434783	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.826087	  0.000000	  0.173913	  0.000000	
  0.000000	  0.086957	  0.739130	  0.173913	

MOTIF TTTTYTTTTYTTTYW MEME-1

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 154 E= 2.7e-059
  0.006494	  0.162338	  0.000000	  0.831169	
  0.116883	  0.000000	  0.136364	  0.746753	
  0.259740	  0.006494	  0.000000	  0.733766	
  0.097403	  0.103896	  0.175325	  0.623377	
  0.071429	  0.337662	  0.149351	  0.441558	
  0.032468	  0.000000	  0.000000	  0.967532	
  0.000000	  0.064935	  0.058442	  0.876623	
  0.214286	  0.162338	  0.110390	  0.512987	
  0.051948	  0.266234	  0.064935	  0.616883	
  0.123377	  0.344156	  0.097403	  0.435065	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	
  0.000000	  0.032468	  0.292208	  0.675325	
  0.000000	  0.000000	  0.019481	  0.980519	
  0.006494	  0.428571	  0.181818	  0.383117	
  0.344156	  0.175325	  0.000000	  0.480519	

MOTIF MA0502.1 NFYB

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 88 E= 7.62e-005
  0.422365	  0.225071	  0.282621	  0.069943	
  0.401140	  0.250570	  0.153561	  0.194729	
  0.401852	  0.250712	  0.167521	  0.179915	
  0.093305	  0.317379	  0.155128	  0.434188	
  0.096011	  0.295726	  0.385613	  0.222650	
  0.403419	  0.155413	  0.424217	  0.016952	
  0.499858	  0.019801	  0.416097	  0.064245	
  0.000000	  0.999999	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.999999	  0.000000	  0.000000	
  0.999999	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.997577	  0.000000	  0.002422	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  0.999999	
  0.058832	  0.680911	  0.243447	  0.016809	
  0.776922	  0.013818	  0.207550	  0.001709	
  0.103276	  0.134330	  0.731623	  0.030769	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0502.1

MOTIF MA0117.2 Mafb

letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 68 E= 1.44e-004
  0.566649	  0.079708	  0.149337	  0.204306	
  0.578825	  0.055455	  0.072870	  0.292851	
  0.494958	  0.098993	  0.083411	  0.322640	
  0.340971	  0.182401	  0.196609	  0.280018	
  0.085300	  0.199677	  0.010017	  0.705006	
  0.000909	  0.006356	  0.990465	  0.002271	
  0.118521	  0.876654	  0.002010	  0.002813	
  0.013773	  0.015994	  0.000889	  0.969344	
  0.018673	  0.005395	  0.905391	  0.070540	
  0.980671	  0.005844	  0.007641	  0.005844	
  0.058204	  0.697791	  0.156701	  0.087305	
  0.266728	  0.063246	  0.296059	  0.373968	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0117.2

MOTIF MA0585.1 AGL1

letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 39 E= 3.34e-004
  0.323061	  0.169248	  0.230776	  0.276915	
  0.184621	  0.092337	  0.138483	  0.584559	
  0.061563	  0.015425	  0.138483	  0.784528	
  0.323061	  0.076954	  0.338453	  0.261532	
  0.000034	  0.999889	  0.000043	  0.000034	
  0.015417	  0.969125	  0.015425	  0.000034	
  0.461501	  0.092337	  0.107718	  0.338444	
  0.476884	  0.061571	  0.123101	  0.338444	
  0.646089	  0.015425	  0.015425	  0.323061	
  0.399973	  0.046190	  0.030807	  0.523031	
  0.215386	  0.215395	  0.138483	  0.430737	
  0.230768	  0.123101	  0.430746	  0.215386	
  0.107710	  0.000043	  0.861448	  0.030798	
  0.061563	  0.000043	  0.861448	  0.076945	
  0.399973	  0.092337	  0.076954	  0.430737	
  0.738383	  0.153865	  0.061571	  0.046181	
  0.599942	  0.138483	  0.123101	  0.138475	
  0.276915	  0.230776	  0.292306	  0.200003	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0585.1

MOTIF 8-GGTCACGTGAYGS STREME-8

letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 74 E= 1.8e+000
  0.014713	  0.057597	  0.798929	  0.128762	
  0.071737	  0.100365	  0.827441	  0.000456	
  0.043225	  0.086109	  0.029084	  0.841582	
  0.000456	  0.813180	  0.157395	  0.028969	
  0.984143	  0.000572	  0.014828	  0.000456	
  0.000456	  0.927234	  0.000572	  0.071737	
  0.000456	  0.029084	  0.955747	  0.014713	
  0.014713	  0.000572	  0.000572	  0.984143	
  0.000456	  0.171652	  0.813180	  0.014713	
  0.741788	  0.029084	  0.171646	  0.057481	
  0.014713	  0.513800	  0.200158	  0.271329	
  0.085999	  0.185908	  0.499538	  0.228555	
  0.128762	  0.499549	  0.257183	  0.114506	

MOTIF MA0517.1 STAT1::STAT2

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 102 E= 5.83e-003
  0.111292	  0.101616	  0.124196	  0.662896	
  0.241935	  0.370967	  0.135486	  0.251613	
  0.693540	  0.011294	  0.243549	  0.051616	
  0.004842	  0.238711	  0.753218	  0.003230	
  0.000004	  0.003230	  0.000004	  0.996762	
  0.004842	  0.003230	  0.000004	  0.991923	
  0.004842	  0.020972	  0.006456	  0.967730	
  0.000004	  0.937086	  0.000004	  0.062906	
  0.411287	  0.120971	  0.308065	  0.159678	
  0.172582	  0.179034	  0.259677	  0.388707	
  0.006455	  0.020972	  0.016133	  0.956440	
  0.016132	  0.003230	  0.000004	  0.980633	
  0.006455	  0.274194	  0.006456	  0.712895	
  0.024197	  0.788702	  0.014520	  0.172582	
  0.045164	  0.588705	  0.058069	  0.308064	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0517.1

MOTIF 7-CAAGATGGC STREME-7

letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 57 E= 1.5e+000
  0.000703	  0.865748	  0.132845	  0.000703	
  0.953579	  0.000882	  0.000882	  0.044658	
  0.997533	  0.000882	  0.000882	  0.000703	
  0.125649	  0.000882	  0.850794	  0.022676	
  0.997533	  0.000882	  0.000882	  0.000703	
  0.000703	  0.066825	  0.144837	  0.787634	
  0.000703	  0.000882	  0.975739	  0.022676	
  0.022676	  0.053975	  0.856702	  0.066647	
  0.000703	  0.960829	  0.000882	  0.037586	

MOTIF MA0773.1 MEF2D

letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 38 E= 3.96e-002
  0.365265	  0.018780	  0.333046	  0.282908	
  0.004759	  0.986233	  0.000000	  0.009007	
  0.000515	  0.003775	  0.000000	  0.995709	
  0.997249	  0.001375	  0.000344	  0.001031	
  0.479242	  0.000000	  0.000345	  0.520412	
  0.881244	  0.000607	  0.000000	  0.118147	
  0.963632	  0.000000	  0.000332	  0.036035	
  0.987744	  0.000340	  0.000170	  0.011745	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  0.999999	
  0.999310	  0.000000	  0.000689	  0.000000	
  0.054997	  0.002758	  0.941433	  0.000811	
  0.496362	  0.402229	  0.010838	  0.090571	

URL http://jaspar2018.genereg.net/matrix/MA0773.1

MOTIF TGCACTCCAGCCTGG MEME-7

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 15 E= 2.1e-005
  0.000000	  0.000000	  0.066667	  0.933333	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.866667	  0.000000	  0.066667	  0.066667	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.133333	  0.000000	  0.000000	  0.866667	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.933333	  0.066667	  0.000000	
  0.933333	  0.066667	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.866667	  0.066667	  0.066667	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	

MOTIF RGCTCACTGCAGCCT MEME-10

letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 20 E= 2.8e-002
  0.650000	  0.000000	  0.350000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  1.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.800000	  0.200000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	
  0.200000	  0.800000	  0.000000	  0.000000	
  1.000000	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.050000	  0.700000	  0.000000	  0.250000	
  0.200000	  0.250000	  0.000000	  0.550000	
  0.050000	  0.050000	  0.900000	  0.000000	
  0.000000	  1.000000	  0.000000	  0.000000	
  1.000000	  0.000000	  0.000000	  0.000000	
  0.150000	  0.000000	  0.850000	  0.000000	
  0.150000	  0.650000	  0.100000	  0.100000	
  0.100000	  0.900000	  0.000000	  0.000000	
  0.000000	  0.000000	  0.000000	  1.000000	

