CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/354.mrc Output diagnostic file name Micrographs/354.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/354.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2386.000 8636.000 Mean, RMS : 4380.811 225.4762 TITLE 1: emi2mrc: 354.emi Mon Jan 20 01:16:21 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 25100, Spot 4, Int 55.12%, Obj 88.08%, Dif 73.67% TITLE 3: X -503.869, Y 542.639, Z -23.326, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.06284 22000.00 8000.00 0.00 -0.06202 22200.00 8000.00 0.00 -0.06059 22400.00 8000.00 0.00 -0.05918 22600.00 8000.00 0.00 -0.05787 22800.00 8000.00 0.00 -0.05670 23000.00 8000.00 0.00 -0.05565 23200.00 8000.00 0.00 -0.05472 23400.00 8000.00 0.00 -0.05384 23600.00 8000.00 0.00 -0.05295 23800.00 8000.00 0.00 -0.05202 24000.00 8000.00 0.00 -0.05106 24200.00 8000.00 0.00 -0.05005 24400.00 8000.00 0.00 -0.04901 24600.00 8000.00 0.00 -0.04796 24800.00 8000.00 0.00 -0.04685 25000.00 8000.00 0.00 -0.04569 25200.00 8000.00 0.00 -0.04450 25400.00 8000.00 0.00 -0.04329 25600.00 8000.00 0.00 -0.04209 25800.00 8000.00 0.00 -0.04099 26000.00 8000.00 0.00 -0.03996 26200.00 8000.00 0.00 -0.03893 26400.00 8000.00 0.00 -0.03784 26600.00 8000.00 0.00 -0.03660 26800.00 8000.00 0.00 -0.03516 27000.00 8000.00 0.00 -0.03361 27200.00 8000.00 0.00 -0.03206 27400.00 8000.00 0.00 -0.03057 27600.00 8000.00 0.00 -0.02924 27800.00 8000.00 0.00 -0.02801 28000.00 8000.00 0.00 -0.02676 28200.00 8000.00 0.00 -0.02540 28400.00 8000.00 0.00 -0.02390 28600.00 8000.00 0.00 -0.02222 28800.00 8000.00 0.00 -0.02041 29000.00 8000.00 0.00 -0.01855 29200.00 8000.00 0.00 -0.01667 29400.00 8000.00 0.00 -0.01482 29600.00 8000.00 0.00 -0.01315 29800.00 8000.00 0.00 -0.01172 30000.00 8000.00 0.00 -0.01060 30200.00 8000.00 0.00 -0.00983 30400.00 8000.00 0.00 -0.00933 30600.00 8000.00 0.00 -0.00896 30800.00 8000.00 0.00 -0.00866 31000.00 8000.00 0.00 -0.00843 31200.00 8000.00 0.00 -0.00827 31400.00 8000.00 0.00 -0.00827 31200.00 10200.00 0.00 -0.00816 31400.00 10200.00 0.00 -0.00815 31000.00 10400.00 0.00 -0.00807 31200.00 10400.00 0.00 -0.00789 31400.00 10400.00 0.00 -0.00787 31000.00 10600.00 0.00 -0.00780 31200.00 10600.00 0.00 -0.00759 31400.00 10600.00 0.00 -0.00757 31000.00 10800.00 0.00 -0.00750 31200.00 10800.00 0.00 -0.00729 31400.00 10800.00 0.00 -0.00727 31000.00 11000.00 0.00 -0.00719 31200.00 11000.00 0.00 -0.00697 31400.00 11000.00 0.00 -0.00697 31000.00 11200.00 0.00 -0.00683 31200.00 11200.00 0.00 -0.00663 31000.00 11400.00 0.00 -0.00643 31200.00 11400.00 0.00 -0.00625 31000.00 11600.00 0.00 -0.00599 31200.00 11600.00 0.00 -0.00584 30800.00 11800.00 0.00 -0.00581 31000.00 11800.00 0.00 -0.00554 31200.00 11800.00 0.00 -0.00543 30800.00 12000.00 0.00 -0.00534 31000.00 12000.00 0.00 -0.00510 31200.00 12000.00 0.00 -0.00501 30800.00 12200.00 0.00 -0.00488 31000.00 12200.00 0.00 -0.00466 31200.00 12200.00 0.00 -0.00460 30800.00 12400.00 0.00 -0.00443 31000.00 12400.00 0.00 -0.00423 31200.00 12400.00 0.00 -0.00419 30800.00 12600.00 0.00 -0.00400 31000.00 12600.00 0.00 -0.00380 31200.00 12600.00 0.00 -0.00378 30800.00 12800.00 0.00 -0.00359 31000.00 12800.00 0.00 -0.00340 31200.00 12800.00 0.00 -0.00339 30800.00 13000.00 0.00 -0.00321 31000.00 13000.00 0.00 -0.00303 30800.00 13200.00 0.00 -0.00287 31000.00 13200.00 0.00 -0.00269 30800.00 13400.00 0.00 -0.00251 31000.00 13400.00 0.00 -0.00234 30800.00 13600.00 0.00 -0.00209 31000.00 13600.00 0.00 -0.00194 30600.00 13800.00 0.00 -0.00183 30800.00 13800.00 0.00 -0.00157 31000.00 13800.00 0.00 -0.00143 30600.00 14000.00 0.00 -0.00117 30800.00 14000.00 0.00 -0.00091 31000.00 14000.00 0.00 -0.00079 30400.00 14200.00 0.00 -0.00073 30600.00 14200.00 0.00 -0.00040 30800.00 14200.00 0.00 -0.00015 31000.00 14200.00 0.00 -0.00004 30400.00 14400.00 0.00 0.00012 30600.00 14400.00 0.00 0.00044 30800.00 14400.00 0.00 0.00068 31000.00 14400.00 0.00 0.00078 30400.00 14600.00 0.00 0.00098 30600.00 14600.00 0.00 0.00130 30800.00 14600.00 0.00 0.00153 31000.00 14600.00 0.00 0.00163 30400.00 14800.00 0.00 0.00182 30600.00 14800.00 0.00 0.00215 30800.00 14800.00 0.00 0.00240 31000.00 14800.00 0.00 0.00250 30400.00 15000.00 0.00 0.00265 30600.00 15000.00 0.00 0.00301 30800.00 15000.00 0.00 0.00327 31000.00 15000.00 0.00 0.00338 30400.00 15200.00 0.00 0.00349 30600.00 15200.00 0.00 0.00388 30800.00 15200.00 0.00 0.00416 31000.00 15200.00 0.00 0.00429 30400.00 15400.00 0.00 0.00435 30600.00 15400.00 0.00 0.00478 30800.00 15400.00 0.00 0.00508 31000.00 15400.00 0.00 0.00520 30400.00 15600.00 0.00 0.00524 30600.00 15600.00 0.00 0.00570 30800.00 15600.00 0.00 0.00601 31000.00 15600.00 0.00 0.00613 30400.00 15800.00 0.00 0.00618 30600.00 15800.00 0.00 0.00664 30800.00 15800.00 0.00 0.00694 31000.00 15800.00 0.00 0.00703 30400.00 16000.00 0.00 0.00715 30600.00 16000.00 0.00 0.00760 30800.00 16000.00 0.00 0.00785 31000.00 16000.00 0.00 0.00789 30400.00 16200.00 0.00 0.00814 30600.00 16200.00 0.00 0.00855 30800.00 16200.00 0.00 0.00875 30400.00 16400.00 0.00 0.00912 30600.00 16400.00 0.00 0.00947 30800.00 16400.00 0.00 0.00961 30400.00 16600.00 0.00 0.01007 30600.00 16600.00 0.00 0.01037 30800.00 16600.00 0.00 0.01044 30200.00 16800.00 0.00 0.01049 30400.00 16800.00 0.00 0.01100 30600.00 16800.00 0.00 0.01124 30800.00 16800.00 0.00 0.01125 30200.00 17000.00 0.00 0.01148 30400.00 17000.00 0.00 0.01194 30600.00 17000.00 0.00 0.01212 30200.00 17200.00 0.00 0.01251 30400.00 17200.00 0.00 0.01293 30600.00 17200.00 0.00 0.01306 30200.00 17400.00 0.00 0.01366 30400.00 17400.00 0.00 0.01403 30600.00 17400.00 0.00 0.01411 30000.00 17600.00 0.00 0.01424 30200.00 17600.00 0.00 0.01493 30400.00 17600.00 0.00 0.01526 30600.00 17600.00 0.00 0.01529 30000.00 17800.00 0.00 0.01565 30200.00 17800.00 0.00 0.01629 30400.00 17800.00 0.00 0.01657 30000.00 18000.00 0.00 0.01708 30200.00 18000.00 0.00 0.01767 30400.00 18000.00 0.00 0.01790 30000.00 18200.00 0.00 0.01845 30200.00 18200.00 0.00 0.01898 30400.00 18200.00 0.00 0.01917 30000.00 18400.00 0.00 0.01971 30200.00 18400.00 0.00 0.02020 30400.00 18400.00 0.00 0.02036 30000.00 18600.00 0.00 0.02087 30200.00 18600.00 0.00 0.02133 30400.00 18600.00 0.00 0.02148 30000.00 18800.00 0.00 0.02201 30200.00 18800.00 0.00 0.02246 30400.00 18800.00 0.00 0.02261 30000.00 19000.00 0.00 0.02318 30200.00 19000.00 0.00 0.02363 30400.00 19000.00 0.00 0.02379 30000.00 19200.00 0.00 0.02439 30200.00 19200.00 0.00 0.02485 30400.00 19200.00 0.00 0.02504 30000.00 19400.00 0.00 0.02565 30200.00 19400.00 0.00 0.02613 30400.00 19400.00 0.00 0.02636 30600.00 19400.00 0.00 0.02637 30000.00 19600.00 0.00 0.02695 30200.00 19600.00 0.00 0.02746 30400.00 19600.00 0.00 0.02772 30600.00 19600.00 0.00 0.02776 30000.00 19800.00 0.00 0.02827 30200.00 19800.00 0.00 0.02882 30400.00 19800.00 0.00 0.02911 30600.00 19800.00 0.00 0.02917 30000.00 20000.00 0.00 0.02964 30200.00 20000.00 0.00 0.03023 30400.00 20000.00 0.00 0.03055 30600.00 20000.00 0.00 0.03062 30000.00 20200.00 0.00 0.03109 30200.00 20200.00 0.00 0.03172 30400.00 20200.00 0.00 0.03207 30600.00 20200.00 0.00 0.03215 30000.00 20400.00 0.00 0.03264 30200.00 20400.00 0.00 0.03330 30400.00 20400.00 0.00 0.03367 30600.00 20400.00 0.00 0.03376 30000.00 20600.00 0.00 0.03429 30200.00 20600.00 0.00 0.03497 30400.00 20600.00 0.00 0.03536 30600.00 20600.00 0.00 0.03543 30000.00 20800.00 0.00 0.03604 30200.00 20800.00 0.00 0.03674 30400.00 20800.00 0.00 0.03711 30600.00 20800.00 0.00 0.03716 30000.00 21000.00 0.00 0.03786 30200.00 21000.00 0.00 0.03854 30400.00 21000.00 0.00 0.03889 30000.00 21200.00 0.00 0.03968 30200.00 21200.00 0.00 0.04034 30400.00 21200.00 0.00 0.04063 30000.00 21400.00 0.00 0.04147 30200.00 21400.00 0.00 0.04208 30400.00 21400.00 0.00 0.04231 30000.00 21600.00 0.00 0.04313 30200.00 21600.00 0.00 0.04368 30400.00 21600.00 0.00 0.04385 30000.00 21800.00 0.00 0.04465 30200.00 21800.00 0.00 0.04517 30400.00 21800.00 0.00 0.04529 30000.00 22000.00 0.00 0.04611 30200.00 22000.00 0.00 0.04660 30400.00 22000.00 0.00 0.04669 30000.00 22200.00 0.00 0.04759 30200.00 22200.00 0.00 0.04808 30400.00 22200.00 0.00 0.04815 29800.00 22400.00 0.00 0.04824 30000.00 22400.00 0.00 0.04925 30200.00 22400.00 0.00 0.04973 30400.00 22400.00 0.00 0.04980 29800.00 22600.00 0.00 0.05013 30000.00 22600.00 0.00 0.05116 30200.00 22600.00 0.00 0.05165 30400.00 22600.00 0.00 0.05171 29800.00 22800.00 0.00 0.05223 30000.00 22800.00 0.00 0.05327 30200.00 22800.00 0.00 0.05375 30400.00 22800.00 0.00 0.05381 29800.00 23000.00 0.00 0.05440 30000.00 23000.00 0.00 0.05543 30200.00 23000.00 0.00 0.05590 30400.00 23000.00 0.00 0.05592 29800.00 23200.00 0.00 0.05651 30000.00 23200.00 0.00 0.05752 30200.00 23200.00 0.00 0.05795 29800.00 23400.00 0.00 0.05844 30000.00 23400.00 0.00 0.05941 30200.00 23400.00 0.00 0.05978 29800.00 23600.00 0.00 0.06018 30000.00 23600.00 0.00 0.06110 30200.00 23600.00 0.00 0.06141 29800.00 23800.00 0.00 0.06186 30000.00 23800.00 0.00 0.06274 30200.00 23800.00 0.00 0.06300 29800.00 24000.00 0.00 0.06358 30000.00 24000.00 0.00 0.06443 30200.00 24000.00 0.00 0.06466 29800.00 24200.00 0.00 0.06537 30000.00 24200.00 0.00 0.06622 30200.00 24200.00 0.00 0.06645 29800.00 24400.00 0.00 0.06726 30000.00 24400.00 0.00 0.06812 30200.00 24400.00 0.00 0.06835 29800.00 24600.00 0.00 0.06924 30000.00 24600.00 0.00 0.07011 30200.00 24600.00 0.00 0.07035 29800.00 24800.00 0.00 0.07125 30000.00 24800.00 0.00 0.07214 30200.00 24800.00 0.00 0.07237 29800.00 25000.00 0.00 0.07339 30000.00 25000.00 0.00 0.07427 30200.00 25000.00 0.00 0.07449 29800.00 25200.00 0.00 0.07574 30000.00 25200.00 0.00 0.07662 30200.00 25200.00 0.00 0.07680 29800.00 25400.00 0.00 0.07827 30000.00 25400.00 0.00 0.07912 30200.00 25400.00 0.00 0.07925 29800.00 25600.00 0.00 0.08092 30000.00 25600.00 0.00 0.08172 30200.00 25600.00 0.00 0.08179 29600.00 25800.00 0.00 0.08190 29800.00 25800.00 0.00 0.08366 30000.00 25800.00 0.00 0.08440 29600.00 26000.00 0.00 0.08462 29800.00 26000.00 0.00 0.08634 30000.00 26000.00 0.00 0.08702 29600.00 26200.00 0.00 0.08726 29800.00 26200.00 0.00 0.08893 30000.00 26200.00 0.00 0.08953 29600.00 26400.00 0.00 0.08990 29800.00 26400.00 0.00 0.09152 30000.00 26400.00 0.00 0.09202 29600.00 26600.00 0.00 0.09252 29800.00 26600.00 0.00 0.09407 30000.00 26600.00 0.00 0.09448 29600.00 26800.00 0.00 0.09505 29800.00 26800.00 0.00 0.09652 30000.00 26800.00 0.00 0.09681 29600.00 27000.00 0.00 0.09750 29800.00 27000.00 0.00 0.09888 30000.00 27000.00 0.00 0.09906 29600.00 27200.00 0.00 0.09985 29800.00 27200.00 0.00 0.10114 30000.00 27200.00 0.00 0.10119 29600.00 27400.00 0.00 0.10210 29800.00 27400.00 0.00 0.10328 29600.00 27600.00 0.00 0.10442 29800.00 27600.00 0.00 0.10550 29600.00 27800.00 0.00 0.10693 29800.00 27800.00 0.00 0.10790 29600.00 28000.00 0.00 0.10950 29800.00 28000.00 0.00 0.11034 29600.00 28200.00 0.00 0.11210 29800.00 28200.00 0.00 0.11279 29400.00 28400.00 0.00 0.11284 29600.00 28400.00 0.00 0.11467 29800.00 28400.00 0.00 0.11517 29400.00 28600.00 0.00 0.11531 29600.00 28600.00 0.00 0.11698 29800.00 28600.00 0.00 0.11726 29400.00 28800.00 0.00 0.11759 29600.00 28800.00 0.00 0.11906 29800.00 28800.00 0.00 0.11907 29400.00 29000.00 0.00 0.11980 29600.00 29000.00 0.00 0.12100 29400.00 29200.00 0.00 0.12162 29600.00 29200.00 0.00 0.12246 29400.00 29400.00 0.00 0.12271 29600.00 29400.00 0.00 0.12312 29400.00 29600.00 5.00 0.12316 29400.00 29600.00 10.00 0.12328 29400.00 29600.00 15.00 0.12339 29400.00 29600.00 20.00 0.12348 29400.00 29600.00 25.00 0.12357 29400.00 29600.00 30.00 0.12363 29400.00 29600.00 35.00 0.12368 29400.00 29600.00 40.00 0.12371 29400.00 29600.00 45.00 0.12373 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 29322.88 29629.67 48.16 0.12380 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/354.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real