CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/040.mrc Output diagnostic file name Micrographs/040.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/040.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2400.000 8456.000 Mean, RMS : 4404.339 227.4517 TITLE 1: emi2mrc: 040.emi Sun Jan 19 14:35:04 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 23630, Spot 4, Int 55.14%, Obj 88.04%, Dif 73.67% TITLE 3: X 271.058, Y -477.264, Z -58.933, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 120 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.04031 17200.00 8000.00 0.00 -0.04014 17400.00 8000.00 0.00 -0.03952 17600.00 8000.00 0.00 -0.03875 17800.00 8000.00 0.00 -0.03785 18000.00 8000.00 0.00 -0.03685 18200.00 8000.00 0.00 -0.03580 18400.00 8000.00 0.00 -0.03476 18600.00 8000.00 0.00 -0.03373 18800.00 8000.00 0.00 -0.03270 19000.00 8000.00 0.00 -0.03163 19200.00 8000.00 0.00 -0.03047 19400.00 8000.00 0.00 -0.02923 19600.00 8000.00 0.00 -0.02794 19800.00 8000.00 0.00 -0.02665 20000.00 8000.00 0.00 -0.02542 20200.00 8000.00 0.00 -0.02426 20400.00 8000.00 0.00 -0.02313 20600.00 8000.00 0.00 -0.02198 20800.00 8000.00 0.00 -0.02075 21000.00 8000.00 0.00 -0.01941 21200.00 8000.00 0.00 -0.01798 21400.00 8000.00 0.00 -0.01650 21600.00 8000.00 0.00 -0.01499 21800.00 8000.00 0.00 -0.01348 22000.00 8000.00 0.00 -0.01196 22200.00 8000.00 0.00 -0.01045 22400.00 8000.00 0.00 -0.00891 22600.00 8000.00 0.00 -0.00735 22800.00 8000.00 0.00 -0.00575 23000.00 8000.00 0.00 -0.00410 23200.00 8000.00 0.00 -0.00241 23400.00 8000.00 0.00 -0.00069 23600.00 8000.00 0.00 0.00106 23800.00 8000.00 0.00 0.00285 24000.00 8000.00 0.00 0.00472 24200.00 8000.00 0.00 0.00671 24400.00 8000.00 0.00 0.00884 24600.00 8000.00 0.00 0.01109 24800.00 8000.00 0.00 0.01342 25000.00 8000.00 0.00 0.01578 25200.00 8000.00 0.00 0.01814 25400.00 8000.00 0.00 0.02044 25600.00 8000.00 0.00 0.02264 25800.00 8000.00 0.00 0.02469 26000.00 8000.00 0.00 0.02647 26200.00 8000.00 0.00 0.02789 26400.00 8000.00 0.00 0.02892 26600.00 8000.00 0.00 0.02955 26800.00 8000.00 0.00 0.02983 27000.00 8000.00 0.00 0.02985 26800.00 8200.00 0.00 0.03002 27000.00 8200.00 0.00 0.03004 26600.00 8400.00 0.00 0.03004 26800.00 8400.00 0.00 0.03032 27000.00 8400.00 0.00 0.03034 26600.00 8600.00 0.00 0.03052 26800.00 8600.00 0.00 0.03079 27000.00 8600.00 0.00 0.03079 26600.00 8800.00 0.00 0.03113 26800.00 8800.00 0.00 0.03139 26600.00 9000.00 0.00 0.03180 26800.00 9000.00 0.00 0.03204 26600.00 9200.00 0.00 0.03244 26800.00 9200.00 0.00 0.03266 26600.00 9400.00 0.00 0.03300 26800.00 9400.00 0.00 0.03319 26600.00 9600.00 0.00 0.03348 26800.00 9600.00 0.00 0.03364 26600.00 9800.00 0.00 0.03396 26800.00 9800.00 0.00 0.03410 26600.00 10000.00 0.00 0.03448 26800.00 10000.00 0.00 0.03462 26600.00 10200.00 0.00 0.03504 26800.00 10200.00 0.00 0.03517 26600.00 10400.00 0.00 0.03558 26800.00 10400.00 0.00 0.03571 26600.00 10600.00 0.00 0.03607 26800.00 10600.00 0.00 0.03618 26600.00 10800.00 0.00 0.03645 26800.00 10800.00 0.00 0.03654 26600.00 11000.00 0.00 0.03674 26800.00 11000.00 0.00 0.03681 26600.00 11200.00 0.00 0.03700 26800.00 11200.00 0.00 0.03705 26600.00 11400.00 0.00 0.03727 26800.00 11400.00 0.00 0.03730 26600.00 11600.00 0.00 0.03759 26800.00 11600.00 0.00 0.03762 26600.00 11800.00 0.00 0.03802 26800.00 11800.00 0.00 0.03805 26400.00 12000.00 0.00 0.03815 26600.00 12000.00 0.00 0.03856 26800.00 12000.00 0.00 0.03859 26400.00 12200.00 0.00 0.03881 26600.00 12200.00 0.00 0.03923 26800.00 12200.00 0.00 0.03927 26400.00 12400.00 0.00 0.03961 26600.00 12400.00 0.00 0.04004 26800.00 12400.00 0.00 0.04009 26400.00 12600.00 0.00 0.04053 26600.00 12600.00 0.00 0.04096 26800.00 12600.00 0.00 0.04102 26400.00 12800.00 0.00 0.04152 26600.00 12800.00 0.00 0.04195 26800.00 12800.00 0.00 0.04201 26400.00 13000.00 0.00 0.04256 26600.00 13000.00 0.00 0.04297 26800.00 13000.00 0.00 0.04301 26400.00 13200.00 0.00 0.04359 26600.00 13200.00 0.00 0.04398 26800.00 13200.00 0.00 0.04400 26400.00 13400.00 0.00 0.04457 26600.00 13400.00 0.00 0.04493 26800.00 13400.00 0.00 0.04494 26400.00 13600.00 0.00 0.04553 26600.00 13600.00 0.00 0.04587 26400.00 13800.00 0.00 0.04648 26600.00 13800.00 0.00 0.04680 26400.00 14000.00 0.00 0.04742 26600.00 14000.00 0.00 0.04774 26400.00 14200.00 0.00 0.04840 26600.00 14200.00 0.00 0.04873 26800.00 14200.00 0.00 0.04875 26400.00 14400.00 0.00 0.04948 26600.00 14400.00 0.00 0.04983 26800.00 14400.00 0.00 0.04987 26400.00 14600.00 0.00 0.05068 26600.00 14600.00 0.00 0.05105 26800.00 14600.00 0.00 0.05111 26200.00 14800.00 0.00 0.05118 26400.00 14800.00 0.00 0.05201 26600.00 14800.00 0.00 0.05240 26800.00 14800.00 0.00 0.05248 26200.00 15000.00 0.00 0.05263 26400.00 15000.00 0.00 0.05347 26600.00 15000.00 0.00 0.05387 26800.00 15000.00 0.00 0.05394 26200.00 15200.00 0.00 0.05409 26400.00 15200.00 0.00 0.05494 26600.00 15200.00 0.00 0.05533 26800.00 15200.00 0.00 0.05539 26200.00 15400.00 0.00 0.05546 26400.00 15400.00 0.00 0.05630 26600.00 15400.00 0.00 0.05668 26800.00 15400.00 0.00 0.05671 26400.00 15600.00 0.00 0.05753 26600.00 15600.00 0.00 0.05790 26800.00 15600.00 0.00 0.05791 26400.00 15800.00 0.00 0.05867 26600.00 15800.00 0.00 0.05903 26400.00 16000.00 0.00 0.05981 26600.00 16000.00 0.00 0.06017 26200.00 16200.00 0.00 0.06027 26400.00 16200.00 0.00 0.06112 26600.00 16200.00 0.00 0.06148 26200.00 16400.00 0.00 0.06178 26400.00 16400.00 0.00 0.06264 26600.00 16400.00 0.00 0.06299 26200.00 16600.00 0.00 0.06346 26400.00 16600.00 0.00 0.06431 26600.00 16600.00 0.00 0.06465 26200.00 16800.00 0.00 0.06522 26400.00 16800.00 0.00 0.06606 26600.00 16800.00 0.00 0.06638 26200.00 17000.00 0.00 0.06698 26400.00 17000.00 0.00 0.06781 26600.00 17000.00 0.00 0.06811 26200.00 17200.00 0.00 0.06869 26400.00 17200.00 0.00 0.06950 26600.00 17200.00 0.00 0.06979 26200.00 17400.00 0.00 0.07040 26400.00 17400.00 0.00 0.07120 26600.00 17400.00 0.00 0.07146 26200.00 17600.00 0.00 0.07220 26400.00 17600.00 0.00 0.07298 26600.00 17600.00 0.00 0.07323 26200.00 17800.00 0.00 0.07408 26400.00 17800.00 0.00 0.07486 26600.00 17800.00 0.00 0.07511 26200.00 18000.00 0.00 0.07607 26400.00 18000.00 0.00 0.07686 26600.00 18000.00 0.00 0.07711 26200.00 18200.00 0.00 0.07816 26400.00 18200.00 0.00 0.07895 26600.00 18200.00 0.00 0.07920 26200.00 18400.00 0.00 0.08026 26400.00 18400.00 0.00 0.08105 26600.00 18400.00 0.00 0.08130 26200.00 18600.00 0.00 0.08237 26400.00 18600.00 0.00 0.08315 26600.00 18600.00 0.00 0.08338 26200.00 18800.00 0.00 0.08450 26400.00 18800.00 0.00 0.08527 26600.00 18800.00 0.00 0.08547 26200.00 19000.00 0.00 0.08662 26400.00 19000.00 0.00 0.08737 26600.00 19000.00 0.00 0.08755 26200.00 19200.00 0.00 0.08871 26400.00 19200.00 0.00 0.08945 26600.00 19200.00 0.00 0.08960 26200.00 19400.00 0.00 0.09083 26400.00 19400.00 0.00 0.09155 26600.00 19400.00 0.00 0.09166 26200.00 19600.00 0.00 0.09295 26400.00 19600.00 0.00 0.09364 26600.00 19600.00 0.00 0.09372 26200.00 19800.00 0.00 0.09505 26400.00 19800.00 0.00 0.09572 26600.00 19800.00 0.00 0.09576 26000.00 20000.00 0.00 0.09580 26200.00 20000.00 0.00 0.09719 26400.00 20000.00 0.00 0.09783 26600.00 20000.00 0.00 0.09785 26000.00 20200.00 0.00 0.09795 26200.00 20200.00 0.00 0.09933 26400.00 20200.00 0.00 0.09995 26000.00 20400.00 0.00 0.10000 26200.00 20400.00 0.00 0.10138 26400.00 20400.00 0.00 0.10198 26000.00 20600.00 0.00 0.10200 26200.00 20600.00 0.00 0.10337 26400.00 20600.00 0.00 0.10396 26000.00 20800.00 0.00 0.10402 26200.00 20800.00 0.00 0.10538 26400.00 20800.00 0.00 0.10595 26000.00 21000.00 0.00 0.10610 26200.00 21000.00 0.00 0.10746 26400.00 21000.00 0.00 0.10801 26000.00 21200.00 0.00 0.10841 26200.00 21200.00 0.00 0.10977 26400.00 21200.00 0.00 0.11030 26000.00 21400.00 0.00 0.11102 26200.00 21400.00 0.00 0.11236 26400.00 21400.00 0.00 0.11287 26000.00 21600.00 0.00 0.11375 26200.00 21600.00 0.00 0.11508 26400.00 21600.00 0.00 0.11553 26000.00 21800.00 0.00 0.11649 26200.00 21800.00 0.00 0.11778 26400.00 21800.00 0.00 0.11818 26000.00 22000.00 0.00 0.11919 26200.00 22000.00 0.00 0.12043 26400.00 22000.00 0.00 0.12076 26000.00 22200.00 0.00 0.12178 26200.00 22200.00 0.00 0.12296 26400.00 22200.00 0.00 0.12321 26000.00 22400.00 0.00 0.12434 26200.00 22400.00 0.00 0.12546 26400.00 22400.00 0.00 0.12564 26000.00 22600.00 0.00 0.12705 26200.00 22600.00 0.00 0.12812 26400.00 22600.00 0.00 0.12822 26000.00 22800.00 0.00 0.12987 26200.00 22800.00 0.00 0.13088 26400.00 22800.00 0.00 0.13090 26000.00 23000.00 0.00 0.13267 26200.00 23000.00 0.00 0.13361 26000.00 23200.00 0.00 0.13543 26200.00 23200.00 0.00 0.13630 26000.00 23400.00 0.00 0.13812 26200.00 23400.00 0.00 0.13891 26000.00 23600.00 0.00 0.14077 26200.00 23600.00 0.00 0.14148 25800.00 23800.00 0.00 0.14172 26000.00 23800.00 0.00 0.14363 26200.00 23800.00 0.00 0.14425 25800.00 24000.00 0.00 0.14490 26000.00 24000.00 0.00 0.14676 26200.00 24000.00 0.00 0.14726 25800.00 24200.00 0.00 0.14821 26000.00 24200.00 0.00 0.14999 26200.00 24200.00 0.00 0.15035 25800.00 24400.00 0.00 0.15155 26000.00 24400.00 0.00 0.15322 26200.00 24400.00 0.00 0.15340 25800.00 24600.00 0.00 0.15483 26000.00 24600.00 0.00 0.15636 25800.00 24800.00 0.00 0.15792 26000.00 24800.00 0.00 0.15929 25800.00 25000.00 0.00 0.16100 26000.00 25000.00 0.00 0.16217 25800.00 25200.00 0.00 0.16419 26000.00 25200.00 0.00 0.16506 25800.00 25400.00 0.00 0.16705 26000.00 25400.00 0.00 0.16753 25800.00 25600.00 0.00 0.16909 25800.00 25800.00 0.00 0.16997 25800.00 26000.00 35.00 0.17001 25800.00 26000.00 40.00 0.17005 25800.00 26000.00 45.00 0.17007 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25728.58 25940.50 49.58 0.17034 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/040.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real