CTF DETERMINATION, V3.5 (9-Mar-2013) Distributed under the GNU General Public License (GPL) Input image file name Micrographs/039.mrc Output diagnostic file name Micrographs/039.ctf CS[mm], HT[kV], AmpCnst, XMAG, DStep[um] 2.0 300.0 0.10 104478.0 14.000 Positive defocus values for underfocus Box, ResMin[A], ResMax[A], dFMin[A], dFMax[A], FStep[A], dAst[A] 360 35.0 5.0 8000.0 40000.0 200.0 0.0 Opening MRC/CCP4 file for READ... File : Micrographs/039.mrc NX, NY, NZ: 4096 4096 1 MODE : real Min, max : 2460.000 7880.000 Mean, RMS : 4405.069 227.0614 TITLE 1: emi2mrc: 039.emi Sun Jan 19 14:34:12 2014 TITLE 2: kV 300, Mag 78000x, Def 23630, Spot 4, Int 55.14%, Obj 88.04%, Dif 73.67% TITLE 3: X 273.298, Y -475.520, Z -58.933, A 0.010 deg, Exposure 1.000 sec READING IMAGE... NX, NY= 4096 4096 TILING IMAGE... Total tiles and number used 121 119 FILTERING POWER SPECTRUM... SEARCHING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 8000.00 8000.00 0.00 -0.03360 16000.00 8000.00 0.00 -0.03343 16200.00 8000.00 0.00 -0.03282 16400.00 8000.00 0.00 -0.03222 16600.00 8000.00 0.00 -0.03155 16800.00 8000.00 0.00 -0.03079 17000.00 8000.00 0.00 -0.02989 17200.00 8000.00 0.00 -0.02886 17400.00 8000.00 0.00 -0.02772 17600.00 8000.00 0.00 -0.02653 17800.00 8000.00 0.00 -0.02532 18000.00 8000.00 0.00 -0.02410 18200.00 8000.00 0.00 -0.02286 18400.00 8000.00 0.00 -0.02159 18600.00 8000.00 0.00 -0.02029 18800.00 8000.00 0.00 -0.01896 19000.00 8000.00 0.00 -0.01763 19200.00 8000.00 0.00 -0.01629 19400.00 8000.00 0.00 -0.01494 19600.00 8000.00 0.00 -0.01358 19800.00 8000.00 0.00 -0.01220 20000.00 8000.00 0.00 -0.01080 20200.00 8000.00 0.00 -0.00938 20400.00 8000.00 0.00 -0.00793 20600.00 8000.00 0.00 -0.00643 20800.00 8000.00 0.00 -0.00491 21000.00 8000.00 0.00 -0.00339 21200.00 8000.00 0.00 -0.00190 21400.00 8000.00 0.00 -0.00045 21600.00 8000.00 0.00 0.00096 21800.00 8000.00 0.00 0.00239 22000.00 8000.00 0.00 0.00385 22200.00 8000.00 0.00 0.00536 22400.00 8000.00 0.00 0.00691 22600.00 8000.00 0.00 0.00847 22800.00 8000.00 0.00 0.01004 23000.00 8000.00 0.00 0.01163 23200.00 8000.00 0.00 0.01326 23400.00 8000.00 0.00 0.01496 23600.00 8000.00 0.00 0.01673 23800.00 8000.00 0.00 0.01855 24000.00 8000.00 0.00 0.02043 24200.00 8000.00 0.00 0.02240 24400.00 8000.00 0.00 0.02450 24600.00 8000.00 0.00 0.02679 24800.00 8000.00 0.00 0.02922 25000.00 8000.00 0.00 0.03168 25200.00 8000.00 0.00 0.03398 25400.00 8000.00 0.00 0.03591 25600.00 8000.00 0.00 0.03731 25800.00 8000.00 0.00 0.03819 26000.00 8000.00 0.00 0.03865 26200.00 8000.00 0.00 0.03885 26400.00 8000.00 0.00 0.03897 26600.00 8000.00 0.00 0.03904 26600.00 8200.00 0.00 0.03907 26600.00 8400.00 0.00 0.03912 26400.00 8600.00 0.00 0.03920 26600.00 8600.00 0.00 0.03931 26200.00 8800.00 0.00 0.03935 26400.00 8800.00 0.00 0.03953 26600.00 8800.00 0.00 0.03963 26200.00 9000.00 0.00 0.03977 26400.00 9000.00 0.00 0.03995 26600.00 9000.00 0.00 0.04004 26200.00 9200.00 0.00 0.04025 26400.00 9200.00 0.00 0.04043 26600.00 9200.00 0.00 0.04050 26200.00 9400.00 0.00 0.04075 26400.00 9400.00 0.00 0.04091 26600.00 9400.00 0.00 0.04097 26200.00 9600.00 0.00 0.04125 26400.00 9600.00 0.00 0.04140 26600.00 9600.00 0.00 0.04145 26000.00 9800.00 0.00 0.04154 26200.00 9800.00 0.00 0.04181 26400.00 9800.00 0.00 0.04196 26600.00 9800.00 0.00 0.04199 26000.00 10000.00 0.00 0.04218 26200.00 10000.00 0.00 0.04245 26400.00 10000.00 0.00 0.04258 26600.00 10000.00 0.00 0.04262 26000.00 10200.00 0.00 0.04283 26200.00 10200.00 0.00 0.04309 26400.00 10200.00 0.00 0.04323 26600.00 10200.00 0.00 0.04326 26000.00 10400.00 0.00 0.04344 26200.00 10400.00 0.00 0.04370 26400.00 10400.00 0.00 0.04383 26600.00 10400.00 0.00 0.04386 26000.00 10600.00 0.00 0.04399 26200.00 10600.00 0.00 0.04425 26400.00 10600.00 0.00 0.04438 26600.00 10600.00 0.00 0.04441 26000.00 10800.00 0.00 0.04448 26200.00 10800.00 0.00 0.04474 26400.00 10800.00 0.00 0.04486 26600.00 10800.00 0.00 0.04489 26000.00 11000.00 0.00 0.04498 26200.00 11000.00 0.00 0.04523 26400.00 11000.00 0.00 0.04535 26600.00 11000.00 0.00 0.04537 26000.00 11200.00 0.00 0.04555 26200.00 11200.00 0.00 0.04579 26400.00 11200.00 0.00 0.04590 26000.00 11400.00 0.00 0.04617 26200.00 11400.00 0.00 0.04640 26400.00 11400.00 0.00 0.04649 26000.00 11600.00 0.00 0.04678 26200.00 11600.00 0.00 0.04699 26400.00 11600.00 0.00 0.04707 26000.00 11800.00 0.00 0.04733 26200.00 11800.00 0.00 0.04753 26400.00 11800.00 0.00 0.04760 26000.00 12000.00 0.00 0.04781 26200.00 12000.00 0.00 0.04801 26400.00 12000.00 0.00 0.04806 26000.00 12200.00 0.00 0.04826 26200.00 12200.00 0.00 0.04846 26400.00 12200.00 0.00 0.04852 26000.00 12400.00 0.00 0.04878 26200.00 12400.00 0.00 0.04898 26400.00 12400.00 0.00 0.04905 26000.00 12600.00 0.00 0.04940 26200.00 12600.00 0.00 0.04962 26400.00 12600.00 0.00 0.04972 26000.00 12800.00 0.00 0.05013 26200.00 12800.00 0.00 0.05038 26400.00 12800.00 0.00 0.05051 26600.00 12800.00 0.00 0.05051 26000.00 13000.00 0.00 0.05097 26200.00 13000.00 0.00 0.05126 26400.00 13000.00 0.00 0.05140 26600.00 13000.00 0.00 0.05141 26000.00 13200.00 0.00 0.05189 26200.00 13200.00 0.00 0.05220 26400.00 13200.00 0.00 0.05235 26600.00 13200.00 0.00 0.05236 26000.00 13400.00 0.00 0.05287 26200.00 13400.00 0.00 0.05318 26400.00 13400.00 0.00 0.05332 26000.00 13600.00 0.00 0.05393 26200.00 13600.00 0.00 0.05423 26400.00 13600.00 0.00 0.05435 25800.00 13800.00 0.00 0.05443 26000.00 13800.00 0.00 0.05506 26200.00 13800.00 0.00 0.05534 26400.00 13800.00 0.00 0.05542 25800.00 14000.00 0.00 0.05561 26000.00 14000.00 0.00 0.05621 26200.00 14000.00 0.00 0.05646 26400.00 14000.00 0.00 0.05651 25800.00 14200.00 0.00 0.05677 26000.00 14200.00 0.00 0.05735 26200.00 14200.00 0.00 0.05757 26400.00 14200.00 0.00 0.05759 25800.00 14400.00 0.00 0.05792 26000.00 14400.00 0.00 0.05848 26200.00 14400.00 0.00 0.05868 26400.00 14400.00 0.00 0.05868 25800.00 14600.00 0.00 0.05907 26000.00 14600.00 0.00 0.05962 26200.00 14600.00 0.00 0.05980 25800.00 14800.00 0.00 0.06029 26000.00 14800.00 0.00 0.06083 26200.00 14800.00 0.00 0.06101 25800.00 15000.00 0.00 0.06167 26000.00 15000.00 0.00 0.06221 26200.00 15000.00 0.00 0.06239 25800.00 15200.00 0.00 0.06317 26000.00 15200.00 0.00 0.06371 26200.00 15200.00 0.00 0.06390 25800.00 15400.00 0.00 0.06471 26000.00 15400.00 0.00 0.06525 26200.00 15400.00 0.00 0.06543 25800.00 15600.00 0.00 0.06625 26000.00 15600.00 0.00 0.06679 26200.00 15600.00 0.00 0.06697 25800.00 15800.00 0.00 0.06776 26000.00 15800.00 0.00 0.06831 26200.00 15800.00 0.00 0.06848 25800.00 16000.00 0.00 0.06930 26000.00 16000.00 0.00 0.06985 26200.00 16000.00 0.00 0.07002 25800.00 16200.00 0.00 0.07100 26000.00 16200.00 0.00 0.07155 26200.00 16200.00 0.00 0.07172 25600.00 16400.00 0.00 0.07180 25800.00 16400.00 0.00 0.07289 26000.00 16400.00 0.00 0.07345 26200.00 16400.00 0.00 0.07360 25600.00 16600.00 0.00 0.07382 25800.00 16600.00 0.00 0.07491 26000.00 16600.00 0.00 0.07545 26200.00 16600.00 0.00 0.07557 25600.00 16800.00 0.00 0.07587 25800.00 16800.00 0.00 0.07695 26000.00 16800.00 0.00 0.07746 26200.00 16800.00 0.00 0.07754 25600.00 17000.00 0.00 0.07783 25800.00 17000.00 0.00 0.07888 26000.00 17000.00 0.00 0.07937 26200.00 17000.00 0.00 0.07941 25600.00 17200.00 0.00 0.07964 25800.00 17200.00 0.00 0.08067 26000.00 17200.00 0.00 0.08113 26200.00 17200.00 0.00 0.08114 25600.00 17400.00 0.00 0.08138 25800.00 17400.00 0.00 0.08241 26000.00 17400.00 0.00 0.08285 25600.00 17600.00 0.00 0.08316 25800.00 17600.00 0.00 0.08419 26000.00 17600.00 0.00 0.08462 25600.00 17800.00 0.00 0.08500 25800.00 17800.00 0.00 0.08605 26000.00 17800.00 0.00 0.08648 25600.00 18000.00 0.00 0.08694 25800.00 18000.00 0.00 0.08800 26000.00 18000.00 0.00 0.08844 25600.00 18200.00 0.00 0.08897 25800.00 18200.00 0.00 0.09005 26000.00 18200.00 0.00 0.09050 25600.00 18400.00 0.00 0.09105 25800.00 18400.00 0.00 0.09216 26000.00 18400.00 0.00 0.09262 25600.00 18600.00 0.00 0.09325 25800.00 18600.00 0.00 0.09438 26000.00 18600.00 0.00 0.09484 25600.00 18800.00 0.00 0.09565 25800.00 18800.00 0.00 0.09678 26000.00 18800.00 0.00 0.09722 25600.00 19000.00 0.00 0.09818 25800.00 19000.00 0.00 0.09930 26000.00 19000.00 0.00 0.09971 25600.00 19200.00 0.00 0.10072 25800.00 19200.00 0.00 0.10182 26000.00 19200.00 0.00 0.10220 25600.00 19400.00 0.00 0.10319 25800.00 19400.00 0.00 0.10428 26000.00 19400.00 0.00 0.10463 25600.00 19600.00 0.00 0.10552 25800.00 19600.00 0.00 0.10659 26000.00 19600.00 0.00 0.10691 25600.00 19800.00 0.00 0.10771 25800.00 19800.00 0.00 0.10877 26000.00 19800.00 0.00 0.10905 25600.00 20000.00 0.00 0.10997 25800.00 20000.00 0.00 0.11100 26000.00 20000.00 0.00 0.11123 25600.00 20200.00 0.00 0.11238 25800.00 20200.00 0.00 0.11337 26000.00 20200.00 0.00 0.11355 25600.00 20400.00 0.00 0.11491 25800.00 20400.00 0.00 0.11587 26000.00 20400.00 0.00 0.11598 25600.00 20600.00 0.00 0.11755 25800.00 20600.00 0.00 0.11846 26000.00 20600.00 0.00 0.11851 25600.00 20800.00 0.00 0.12018 25800.00 20800.00 0.00 0.12104 25600.00 21000.00 0.00 0.12270 25800.00 21000.00 0.00 0.12350 25600.00 21200.00 0.00 0.12518 25800.00 21200.00 0.00 0.12593 25400.00 21400.00 0.00 0.12613 25600.00 21400.00 0.00 0.12780 25800.00 21400.00 0.00 0.12849 25400.00 21600.00 0.00 0.12890 25600.00 21600.00 0.00 0.13055 25800.00 21600.00 0.00 0.13120 25400.00 21800.00 0.00 0.13182 25600.00 21800.00 0.00 0.13344 25800.00 21800.00 0.00 0.13405 25400.00 22000.00 0.00 0.13489 25600.00 22000.00 0.00 0.13649 25800.00 22000.00 0.00 0.13705 25400.00 22200.00 0.00 0.13799 25600.00 22200.00 0.00 0.13955 25800.00 22200.00 0.00 0.14004 25400.00 22400.00 0.00 0.14107 25600.00 22400.00 0.00 0.14258 25800.00 22400.00 0.00 0.14298 25400.00 22600.00 0.00 0.14428 25600.00 22600.00 0.00 0.14571 25800.00 22600.00 0.00 0.14601 25400.00 22800.00 0.00 0.14758 25600.00 22800.00 0.00 0.14893 25800.00 22800.00 0.00 0.14912 25400.00 23000.00 0.00 0.15093 25600.00 23000.00 0.00 0.15219 25800.00 23000.00 0.00 0.15226 25400.00 23200.00 0.00 0.15437 25600.00 23200.00 0.00 0.15554 25400.00 23400.00 0.00 0.15784 25600.00 23400.00 0.00 0.15891 25200.00 23600.00 0.00 0.15902 25400.00 23600.00 0.00 0.16129 25600.00 23600.00 0.00 0.16225 25200.00 23800.00 0.00 0.16276 25400.00 23800.00 0.00 0.16494 25600.00 23800.00 0.00 0.16576 25200.00 24000.00 0.00 0.16685 25400.00 24000.00 0.00 0.16891 25600.00 24000.00 0.00 0.16956 25200.00 24200.00 0.00 0.17122 25400.00 24200.00 0.00 0.17312 25600.00 24200.00 0.00 0.17355 25200.00 24400.00 0.00 0.17585 25400.00 24400.00 0.00 0.17753 25600.00 24400.00 0.00 0.17768 25000.00 24600.00 0.00 0.17789 25200.00 24600.00 0.00 0.18050 25400.00 24600.00 0.00 0.18189 25000.00 24800.00 0.00 0.18224 25200.00 24800.00 0.00 0.18453 25400.00 24800.00 0.00 0.18555 25000.00 25000.00 0.00 0.18558 25200.00 25000.00 0.00 0.18752 25400.00 25000.00 0.00 0.18812 25200.00 25200.00 0.00 0.18924 25400.00 25200.00 0.00 0.18933 25200.00 25400.00 10.00 0.18941 25200.00 25400.00 15.00 0.18955 25200.00 25400.00 20.00 0.18968 25200.00 25400.00 25.00 0.18979 25200.00 25400.00 30.00 0.18989 25200.00 25400.00 35.00 0.18997 25200.00 25400.00 40.00 0.19002 25200.00 25400.00 45.00 0.19005 25200.00 25400.00 50.00 0.19006 REFINING CTF PARAMETERS... DFMID1 DFMID2 ANGAST CC 25162.22 25417.64 47.47 0.19009 Final Values Opening MRC/CCP4 file for WRITE... File : Micrographs/039.ctf NX, NY, NZ: 360 360 1 MODE : real